Stephen Jameson rencontre " les gens de demain" un genre d'humains génétiquement très évolués possédant des capacités de télékinésie, téléportation et la télépathie. Il apprend alors qu'il a ces pouvoirs, raison pour laquelle il se réveille ailleurs que dans son lit chaque matin. Il n'est pas somnambule : il a des capacités de se téléporter. D'abord incrédule, il apprend aussi que les "gens de demain" sont pourchassés par un groupe paramilitaire de scientifiques, appelés Ultra, qui considèrent les gens de son espèce, comme une menace pour l'humanité.

Quand Ultra essaie de sonder le cerveau de Stephen, celui-ci demande l'aide de ses amis Tomorrow People mais il est repoussé par un John en colère, laissant Cara aider Stephen derrière son dos. Parallèlement, Ultra traque l'identité d'une nouvelle révélation qui a utilisé ses pouvoirs pour commettre des crimes.

Stephen assiste à contrecœur à une fête avec Astrid mais il est surpris quand il apprend que l'un de ses camarades de classe est en danger. Souhaitant plus que tout l'aider, Stephen se tourne vers John et Cara, mais ils indiquent clairement qu'ils ne veulent pas aider les humains.

Quand le plus recherché d'Ultra, Killian McCrane refait surface après des années dans la clandestinité, Stephen demande l'aide de John pour le traquer. John accepte à contrecœur d'aider mais se ravise lorsqu'il apprend que Killian n'est pas après Jedikiah comme tout le monde le suspecte.

Après que Stephen ait rompu le protocole Ultra pendant un exercice d'entraînement, le patron mystérieux de Jedikiah insiste pour rencontrer Stephen. Stephen devient de plus en plus préoccupé quand il apprend Jedikiah est incapable de le protéger, de sorte qu'il se tourne vers John, qui est seulement intéressé pour des raisons égoïstes.

Quand Stephen et Russell sortent pour une nuit de plaisir, ils se heurtent à une nouvelle découverte potentielle. Stephen et Russell rendent compte à John et Cara sur la nouvelle personne, mais ils veulent faire profil bas vis-à-vis d'Ultra. Malheureusement, Russell apprend que son père est décédé et il est déchiré sur si oui ou non il doit rentrer à la maison.

Quand Stephen décide de s'amuser un peu avec ses nouveaux pouvoirs, Jedikiah prend des mesures extrêmes pour s'assurer que ça se reproduise pas. Après le retour de voyage de John et Russell, John ressent une tension étrange entre lui et Cara. Stephen tente de gérer une nouvelle découverte dangereuse de son propre chef, mais se trouve dépassé et a besoin de l'aide de ses compagnons Tomorrow People.

Stephen est déterminé à découvrir ce qu'il espère être la clé pour trouver son père et prépare un plan avec les Tomorrow People qui implique d'aller à l'intérieur de la tête de Jedikiah. Pendant ce temps, Cara et Russell rencontrent un visiteur non invité dans le tunnel du métro. Stephen prend une opportunité risquée et fouine autour d'Ultra.

Quand John se retrouve dans une situation dangereuse, Stephen n'est pas en mesure d'aider sans se révéler à Ultra. Non satisfait de la réponse qu'il a découvert sur ​​la disparition de son père, Stephen décide de prendre des mesures drastiques avec l'aide de ses collègues Tomorrow People pour découvrir la vérité. Pendant ce temps, Cara et Russell négocient un échange avec Jedikiah, ce qui pousse finalement Jedikiah à prendre un gros risque.

Après que Stephen soit de retour du gouffre, il pense qu'il a une idée de ce qui est arrivé à son père, mais ses amis les Tomorrow People ne sont pas convaincus. Les Tomorrow People obtiennent enfin une avancée sur le laboratoire de recherche secret d'Ultra, et ils élaborent un plan dangereux dans le but de libérer tous ceux qui y sont détenus en captivité. Pendant ce temps, la mère de Stephen présente à Stephen et son frère Luca le nouvel homme dans sa vie, mais Stephen n'arrive pas à lire ses pensées.

Jedikiah donne un test à Stephen et ses collègues apprentis Ultra pour déterminer qui est capable de devenir un agent Ultra. Mais tout le monde n’a pas envie de travailler en équipe. Cara reçoit la visite d’un membre mystérieux de son passé. Russell est envoyé dans une mission de reconnaissance plutôt dangereuse qui pourrait mener à un clash entre les Tomorrow People. Pendant ce temps, John travaille avec un nouveau Break-out.

Stephen ne se sent pas très à l’aise avec sa nouvelle collègue Hillary qui a de mauvaises intentions. La mère de Stephen veut emmener toute la petite famille faire du camping, y compris son nouveau compagnon Peter, dont Stephen à du mal à lire les pensées. Sachant qu’il va quitter la ville, Stephen demande à John et Cara de veiller sur Astrid pendant son absence.

Stephen en veut à Jedikiah d'être revenu sur sa parole, le laissant de nouveau face au fondateur. Pour protéger Astrid, Stephen doit faire un pacte dangereux pour faire entre un break-out puissant. John et Cara ont un différend, ce qui force Cara à prendre des mesures de punition dures et étonnantes. Pendant ce temps, Stephen apprend un secret surprenant sur sa mère.

Après avoir appris des nouvelles plutôt choquantes Stephen essaye de remettre de l’ordre dans ses deux mondes en faisant un pacte avec Jedikiah. Avec un nouveau break-out dans les radars, Cara et Russell essayent de le rallier à leur cause mais vont tomber dans un piège d’Ultra. Pendant ce temps, Jedikiah est sur le point de développer une nouvelle technologie secrète qui pourrait changer son futur.

Julian est de retour, plus énervé que jamais. Mais quand il se fait prendre par Ultra il est obligé de faire un deal qui pourrait lui coûter sa vie et celle de Stephen. John désobéit une fois de plus aux ordres de Cara quand il apprend que Julian a découvert la planque des Tomorrow People. Pendant ce temps Astrid subit des cauchemars à répétition depuis son expérience proche de la mort et se tourne vers son nouvel ami John pour trouver du réconfort.

Une jeune femme masquée s'introduit chez les gens et combat le crime. Ultra veut mettre la main sur elle mais Russell et Stephen y parviennent avant. Russell pense connaitre la femme masquée, mais ce n'est pas elle. Russell et Stephen aide la femme à délivrer la famille du juge d'une enquête importante et disparaissent avant qu'Ultra ne débarque. Pendant ce temps, la femme de Jedikiah le retrouve pour pouvoir lire dans ses pensées afin de retrouver le père de Stephen. Elle se fait prendre mais John la sauve en avouant a Jedikiah qu'elle est enceinte. Suite aux informations trouver par Morgane, John laisse Cara lire dans ses pensées pour retrouver l'endroit où est retenu le père de Stephen. Stephen se rend chez lui pour prendre l'objet qui appartenait à son père et alors qu'il partait, sa partenaire chez Ultra débarque chez lui et l'embrasse. Stephen retrouve son père enfermé dans un aquarium et Jedikiah le surprend.

Stephen tombe sur une preuve que les Tomorrow People sont désespéramment recherchés. John et Russell apprennent que Jedikiah a mis en place un plan dangereux, dont personne n’avait prévu les effets. Pendant ce temps Cara apprend des infos sur un nouvel éveillé, mais est choquée de découvrir qu’il s’agit de quelqu'un qu’elle connait.

Agacé par les mensonges à répétition de Jedikiah au sujet de son père, Stephen fait un choix dans ses alliances. Croyant en Ultra et Hillary, Stephen veut ramener un éveillé pour voir si les choses ont réellement changées, au grand désarroi de Cara. Par ailleurs, le frère de Stephen, Luca est porté disparu après que Jedikiah ait forcé Stephen à le protéger.

Le travail acharné de Stephen en tant qu’agent double semble commencer à payer avec une potentielle trêve entre Ultra et les Tomorrow People. Toujours méfiante, Cara envoie Russell rencontrer le Fondateur. Jedikiah est désormais en cavale et déterminé à cacher son secret à Ultra. Pendant ce temps Stephen, avec l’aide d’Hillary réessaye de contacter son père.

Avec le possible retour de Roger à l’horizon, tout le monde s’inquiète de la réaction du Fondateur s’il l’apprenait. Stephen connait maintenant la vérité sur la Machine et la raison pour laquelle il l’a fait s’entraîner avec. Maintenant il a besoin de John et Cara pour l’aider à la détruire. Pendant ce temps Russell et d’autres Tomorrow People ont perdu l’espoir de trouver un jour le refuge et décident de partir de leur côté.

Quand les Tomorrow People apprennent à quoi sert le sérum qu’ils se sont fait injecter, Stephen et Cara essayent de gagner du temps pour que Jedikiah puisse créer un antidote. Impatients, Russell et les autres Tomorrow People sauvages prennent la grave décision de sacrifier Roger à Ultra pour leur propre sécurité. John a quant à lui des difficultés à comprendre son nouveau rôle et la seule personne vers qui il peut se tourner pour avoir des conseils est Astrid.

Russell réalise que son alliance avec le Fondateur était une erreur, et il tente de rattraper sa décision en sauvant Cara d'une embuscade d'Ultra. Stephen comprend qu'il doit être le seul à arrêter la Machine et l'extermination de l'humanité, mais il craint qu'il soit trop tard. Russell propose un plan pour aider Stephen, mais il va avoir besoin de l'aide de tout le monde, y compris John et Astrid, s'ils veulent avoir une chance de survivre. Pendant ce temps, Jedikiah offre une opportunité intéressante à John qui pourrait les faire travailler ensemble de nouveau.