Envoyé en mission pour capturer Edgar Standish, un traître de la NSA ayant volé des données vitales pour la sécurité des Etats-Unis, Will Chase dont le nom de code est Whiskey Cavalier, croise la route de Frankie Trowbridge, agent de la CIA aux méthodes plus qu’expéditives. Avec l’aide de leurs équipes respectives, ils vont mettre à jour une terrible trahison et poser les fondements de leur future coopération.

Whiskey et son équipe sont chargés de récupérer un mystérieux carnet appartenant à un certain Stavros Pappas, un truand notoire. Selon la légende, ce cahier contiendrait la totalité de ses transactions illicites ainsi que les noms de tous ses clients, soit l’identité de la moitié des criminels de la planète. Whiskey et son équipe se lancent à la recherche de ce précieux carnet et se rendent compte qu'ils ne sont pas les seuls...

Will et son équipe sont chargés d'aller à Rome, retrouver un homme soupçonné de fabriquer une bombe pour une faction d’extrême-droite. Ils parviennent à l’exfiltrer et il accepte de leur fournir les informations qu’ils demandent à condition qu’ils s’engagent à protéger sa fille. Mais celle-ci est enlevée sous leurs yeux et l’homme, abattu par un tueur de l’organisation fasciste. Au moment de mourir, il leur avoue que la bombe est prête et censée exploser le jour même, pendant la fête très populaire de la Toussaint. Will et ses acolytes se lancent alors à la recherche de la bombe...

Un général roumain en exil veut renverser le pouvoir de son pays grâce à un puissant gaz neurotoxique. Will et Frankie sont envoyés en tant qu’agents infiltrés au mariage de sa fille grâce à l’invitation du fiancé, lui-même agent d’Interpol. Mais leur couverture, un couple marié venu célébrer cette union, est mise à mal par les visions diamétralement opposées des deux agents sur le sujet. Par ailleurs, Susan a du mal à supporter de ne pas être sur le terrain.

Will et Frankie compromettent, sans le vouloir, un plan des services secrets britannique, le MI6. Ils se retrouvent donc contraints de travailler avec eux et en particulier avec l’agent Emma Davis, une charmante jeune femme qui plaît beaucoup à Will. Ils enquêtent donc avec les Anglais sur une série de cambriolages perpétrés chez des personnalités politiques britanniques...

Alors qu’ils enquêtent sur un trafic de stupéfiants en Bulgarie, Will et Jai découvrent un bébé dans un camion rempli de narcotiques. En apprenant que le trafiquant de drogue est aussi un trafiquant d’être humains, Will et son équipe décident de retourner sur place pour arrêter le criminel et retrouver la famille du bébé. Les choses se compliquent quand ils réalisent que Vlad, le chef de la police locale à qui ils sont venus demander de l’aide, est aussi le chef du réseau criminel.

Frankie, Susan et Will sont rejoints par la nouvelle amie de ce dernier alors qu'ils se rendent en Espagne pour récupérer du plutonium tombé entre de mauvaises mains. Dans le même temps, Standish tente d'améliorer ses techniques de séduction.

Whiskey, Frankie et le reste de l'équipe sont chargés d'escorter un dangereux prisonnier possédant des informations sur le Trust. A leur grande surprise, ils découvrent un individu qu'ils croyaient mort.

Will est enlevé au cours d'une opération visant à démanteler un réseau de trafic d'organes. Frankie prend la tête du groupe pour le retrouver. Mais sa façon de faire déboussole le reste de l'équipe.

La petite amie de Will, Emma Davies, est assassinée à Berlin alors qu'elle enquêtait sur le Trust. L'équipe, choquée, décide de partir en quête du tueur présumé, Griffin, un espion allemand. Mais tandis que Will ne semble pas tout à fait prêt à se lancer dans cette mission, Jai et Standish tentent de discuter à cœur ouvert.

L'équipe se rend incognito dans une université afin d'arrêter sa nouvelle cible : un ingénieur prodige qui serait en train de mettre au point une arme très puissante...

Afin de mener des investigations sur son mari impliqué dans un cartel de drogue, Frankie prétexte une enquête financière pour reprendre contact avec Kelly, qui l'avait recueillie à la mort de ses parents. Elle découvre alors que la femme rigide et fermée qu'elle a connue a beaucoup changé. Elle est devenue une mère de famille douce et aimante.

Afin de forcer l'équipe à commettre une attaque terroriste pour le compte de Trust, Ollerman menace de tuer Ray. De son côté, Jai fait son possible pour aider Standish à tenir le choc face aux révélations au sujet de sa petite amie.